我的论文已经投稿，但是还没有发表，我的导师要申请专利，会影响导师申请专利吗？

答：不会。
理由：根据专利法第二十二条 “授予专利权的发明和实用新型，应当具备新颖性、创造性和实用性。
新颖性，是指该发明或者实用新型不属于现有技术；也没有任何单位或者个人就同样的发明或者实用新型在申请日以前向国务院专利行政部门提出过申请，并记载在申请日以后公布的专利申请文件或者公告的专利文件中。
......本法所称现有技术，是指申请日以前在国内外为公众所知的技术。"
你的论文已投稿，还未发表，表示该 论文还未公开，在正式发表前，该论文不会影响申请专利。不过你应尽快提出专利申请，以免因论文公开发表影响专利申请。

如果光是申报的话，应该是没问题的
但是这个东西牵扯到以后一个维权的问题
你导师9月份申请专利，如果通过国家专利局授权，其授权的时间应该是超过12月了，万一以后有别人用到你导师的这个技术，那么你们很难告他侵权，因为他可以找到更早的公知文献——也就是你12月份发表的论文。

不会影响。

论文要公开了才是现有技术，没公开当然不会影响你导师专利的新颖性了。

申请专利 跟你发表论文不冲突
冲突的是你导师申请专利到通过的时间 是在你发论文之前还是之后了
如果是之后 那估计就会影响

不会的，如果没有公开发表，您的文章是不是会公开查询到的，自然也不影响到你导师的申请