A、cDNA文库含有该种生物的部分基因，基因组文库含有该种生物的全部基因，A错误；B、cDNA文库不含启动子和内含子，基因组文库含有启动子和内含子，B错误；C、文库的基因是通过受体菌承载的，C正确；D、基因组文库中包含了某种生物的所有基因，只有一种，而cDNA文库比较小，只含一部分基因，故有很多种，D错误．故选：C．
