as在这里是一个连词，相当于when引导时间状语从句i did so。so指代前面的I applied这件事情。
不可以在did后面加it，因为和so重复。
that后面的成分是非谓语动词引导的fearing的宾语从句，表示申请时候的心理状态。as I did so 是时间状语从句，可以放在整个句子后面。
（Being short of money and wanting to do something useful原因状语）,（ I主 applied谓）,【 fearing）（ as I did so时间状语从句，as连词）,（ that without a degree and with no experience of teaching条件状语 my chances of landing the job主 were系 slim表：宾语从句）伴随状语】
语序没必要改。
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