现代农产品运输方式有铁路运输、公路运输、水上运输和航空运输。
铁路运输载运量大，连续性强，行驶速度较高，运费较低，运行一般不受气候、地形等自然条件的影响，适合于中长途客货运输。
公路运输虽载运量较小，运输成本较高，但机动灵活性较大，连续性较强，适合于中、短途客运和高档农业产品的运输。为了促进鲜活农产品的流通，我国开设了鲜活农产品绿色通道，在通道上，对整车合法装载运输鲜活农产品车辆免收车辆通行费。“绿色通道”网络的公路收费站点，按规定开辟“绿色通道”专用道口，设置“绿色通道”专用标识标志，引导鲜活农产品运输车辆优先快速通过。
水运（包括内河和海上运输）具有载运量大、运输成本低、投资省、速度较慢、灵活性和连续性较差等特点，适于大宗、低值和多种散装农产品的运输。
航空运输具有速度快、投资少、不受地方地形条件限制、能进行长距离运输等优点，也存在载运量小、运输成本高、易受气候条件影响等缺点，适合于远程客运及高档、外贸农产品与急需农产品的运输。
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