医院住院部设有36个病区，包括心血管内科、消化内科、肾内科（含血液净化室）、神经内科、呼吸内科、内分泌科、血液科、风湿免疫科、综合科、普通内科、泌尿外科（含体外碎石室）、胃肠甲状腺外科、乳腺外科、心胸血管外科、肝胆外科、皮肤科、肛肠科、一肿瘤科、二肿瘤科、三肿瘤科、四肿瘤科、创伤骨科、脊柱骨科、关节一科、关节二科（骨伤康复、运动损伤康复）、颅脑科、一妇科、二妇科、儿科、眼科、耳鼻喉科、针灸科、重症监护科及产科、新生儿科。
医院门诊各科齐全：有内科、外科、骨伤科、妇科、儿科、针灸科、肿瘤科、推拿科、运动康复科、口腔科、皮肤科、泌尿男科、肛肠科、眼科、耳鼻喉科、保健体检科等，其中70多个中医专科专病门诊，如内科：心血管、脾胃、血证、肝炎、重症肌无力、肾病、哮喘、系统性红斑狼疮、热病、糖尿病、癫痫、类风湿关节炎、甲亢专科等。外科：泌尿外科、心脏外科、肝胆外科、胃肠外科、男科、乳腺病、结石、痛证专科等。妇科：月经病、不孕不育、胎动不安、妇科肿瘤等。儿科：小儿多动症、肾病、哮喘病专科等。骨伤科：股骨头坏死、退行性关节病、脊柱病、颅脑病、运动损伤康复等专科。针灸科：老年性痴呆、儿童弱智、肥胖症、中风偏瘫等专科。眼科：眼底病、高度近视、白内障等专科。耳鼻喉科：耳鸣、耳聋、鼻咽癌、慢性咽炎等专科。皮肤科：银屑病、红斑狼疮、美容、性病专科等。肛肠科：肛裂、痔疮。肿瘤科：肺癌、肝癌、肠癌等专科。此外，设有肝炎门诊、肠道门诊、发热门诊。
医院医疗实力雄厚，拥有8个国家级重点专科专病（髋关节病专科、肿瘤科、妇科、心血管病专科、针灸科、耳鼻喉科、糖尿病专病、全国中医急诊临床基地），已进入国家重点专科专病单位数量最多的医院行列，其中多个专科专病成为全国协作组组长或副组长单位；并拥有省级重点专科专病17个（髋关节病专科、耳鼻喉专科、心血管病专科、肿瘤专科、妇科专科、呼吸病专科、脑病专科、肾病专科、糖尿病专科、眼底病专科、泌尿男科专科、类风湿专科、脾胃病专科、创伤骨科专科、脊柱病专科、血症（血液病）专科、针灸科）。在07年卫生部中国最佳医院之专科排名榜（中西医院一起排序）中，我院妇科排名第八位，骨科排名第九位，在广东省乃至全国中医医疗机构中排名第一。医院在运用中医温病学理论防治病毒性疾病方面具有丰富的成功经验。在2003年抗击“非典型肺炎”的战斗中，作为广东省中医治疗非典专家组组长单位，成功采用中西医结合方法治愈70例确诊非典型肺炎病人，并应邀会诊了市八人民医院、中山二院、中山三院、省中医院等37名病人，取得了“抗非”战役的“双零”（零死亡率、零院内感染）战绩，受到省市政府的表彰，中医的疗效受到世界卫生组织专家的赞赏，医院应邀在香港、台湾等地区推广传授“非典”的“综合治疗方案”。
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