单位是否合法取决于双方是否有书面约定。
1、如果单位与员工有过关于年终奖发放金额书面约定的,单位少发是不合法的。
2、如果单位与员工没有书面约定,单位只发一部分的,甚至不发的,视为单位自主权。
《民事审判若干问题的解答》
十三、用人单位就年终奖问题规定以某个时间点为分界线,如规定三月份在职的职工可以领取上一年度的年终奖,现在该时间点之前离职的劳动者主张上年度的年终奖,应否支持?
答:关于年终奖的问题,用人单位与劳动者有约定的,从其约定;在没有约定的情况下,年终奖的性质更属于一种激励机制,用人单位根据其经营状况决定是否发放年终奖以及如何发放年终奖,是其企业的经营自主权的合理范围,应当予以尊重。