A、构成物质的微粒有分子、原子和离子,如铁是由铁原子构成的,故A错误;B、化学变化的过程是分子分解成原子,原子重新组合成新分子,在化学变化中分子可以再分,而原子不能再分,正确C、原子是化学变化中的最小微粒,由分子构成的物质,分子是保持物质化学性质的最小微粒,C错误;D、分子和原子不能比较大小,只能说分子比构成它的原子大,故D错误;故选B