在养成期，应维持养殖环境稳定，确保水质符合安全生产水质条件。通常情况下水位应维持一定水平，当水质状况如水色、理化指标发生较大变化时，可采取换水或使用化学药剂的方式，调节水体pH、氨氮、硫化物、溶解氧、透明度和重金属等。通过水色观察和计数，可粗略判断单胞藻的种类和数量是否合适。水不够肥时，可在养殖池中加入适量肥料以促进单胞藻的生长。
养殖前期应逐渐向池塘加水，中后期视水质情况适当换水。可通过换水调节水温。应防止大排大灌，以少量多次为原则交换水体。可使用石灰调节水体pH，使用沸石粉吸附有害物质，使用有益微生物改良水质，使用增氧机增加水体溶氧量。阴天及雨前雨后，及时开动增氧机，防止生物因缺氧而发生的浮头现象。
日常管理中要坚持每日对养殖场进行巡察，以便对其内外情况有全面的了解，从而及早发现问题并及时解决。观察内容主要是水质情况以及水生生物的活动与摄食情况。如发现生长不良或病态，必须迅速查找原因，有针对性地采取措施。每天的巡视情况要记录存档。
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