办个人旅游签证需要缴纳归国保证金，但是这个押金不用交给旅行社，而是要存到旅行社指定的银行里，办理银行第三方托管手续才可以的。这样的话，既能保证旅行社在客人滞留不归时的利益不受损，又能避免客人回国后旅行社挪用押金保证客人的利益。
具体需要多少押金主要是看旅行社如何判断风险了，如果觉得客人滞留不归的可能性很低时，就会象征性地收一些（一般需要3-5万一人），如果风险高的话，就会多收一些（10万以上一人）。
不知道你是以什么方式去日本，因为赴日签证有好多种。个人旅游签证日本领事馆是不直接受理的，都是通过旅行社或是其他代办机构来受理的。可以咨询一下相关的旅行社，我的日本旅游签证是在众信办的，因为记录不错，所以没有收押金，我朋友去日本，收了10w押金，回来退给他了。只要资料齐全，领事馆是不会卡住的。当然你的护照上要是有美国签证或是其他欧洲国家的签证，拒签的概率几乎为零。
签证办理需要的是代办费，一般500-700左右，押金是不要的。
通过旅行社去一般都要押金
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