A、种群是生物进化的基本单位，生殖隔离是形成新物种的标志，A错误；
B、生物变异包括不可遗传的变异和可遗传的变异，只有可遗传变异才能为生物进化提供原材料，自然选择决定生物进化的方向，B错误；
C、生物进化的实质是种群基因频率的改变，自然选择决定生物进化的方向．因此自然选择使种群基因频率发生定向改变，导致生物向一定方向进化，C正确；
D、共同进化是指生物与生物之间、生物与环境之间的共同进化，生物多样性的形成是共同进化的结果，D正确．
故选：CD．
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