首先，重开一张你不该作废的那张票给对方，同时让对方把原来的票寄回。至于该作废却未作废的，你可以让对方给你开具一个盖了公章的退票说明，然后在税控系统里开具红字发票申请单，然后去税务局进行相应处理
是增值税专用发票还是增值税普通发票？
要是普通发票，把不该作废但已作废的那张，向客户要回来，再补开一张给客户。应该作废但未作废的那张，开红字发票（负数发票）。
如果是增值税专用发票，那就向自己的专管员申请开一张红字发票（应该作废但未作废的那张），不该作废但已作废的那张发票请客户退回（你们这边作废了，他们也认证不了的），再补开的正确发票寄给客户。
这笔销项不用和其他的区分开，就是按正常的销项税填就行。
不该作废的你作废了，那就回收客户联，然后重开就OK。
该作废的你没有作废，那就得开红字发票。流程比较麻烦。你咨询你当地税局须要你走怎样的流程。最起码买卖双方都要写红字开票证明，盖财务章。交税所审核。
对方认证了,要对方去税务局申请了,要准备好多资料哦!
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