一、关于房租。如果合同条款没有其它约定,那么:
1、2013年4月10日起,计算至2014年4月9日止,一年租期,4万元
2、2014年4月10日起,计算至收拾东西走人的那天止,以年租金4万元,平均计算租赁期间房租。
二、关于违约金或赔偿金
违约金和赔偿金的给付,是要以对你造成了实际损失为基础,如果你们没有事先约定,那么违约金和赔偿金只能以你们的实际损失为限。
综上,你文中所述,他们只愿意付一年零三个月的房租,我认为并无不妥。违约金和赔偿金,如果他们给你方利益造成了实际损害,我建议在诉讼过程中向法官提出,要求对方承担你们的实际经济损失。