虽然自根苗苗木整齐，产量较高且稳产性能较好，结果较早，省却嫁接这一栽培措施等，为人们展示了利用自根苗的美好前景，并且果树自根苗繁殖和栽培是果树生产发展的方向，但至少目前在生产上，利用砧穗嫁接的嫁接苗繁殖和栽培仍居主导地位，而且苹果生产上几乎都是应用的嫁接苗。此外，从种质资源学的角度看，砧木对风土和自然环境的适应能力、对旱、涝、寒、热、病、虫、盐碱、酸、养分盈亏胁迫等许多方面，都有不可替代的重要性，而且，种子一般不带病毒。因此，充分勘察清楚自然界可用作砧木的野生、半野生、甚至栽培种，并对其妥善保护和保存，详细科学地了解其性状，并加以科学研究和利用，是包括苹果属在内的果树种质资源学的主要内容之一。
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