老人生前签的关于财产的处置协议是有效的。但协议的有效性不影响第三方主张权益,即:你爷爷的协议有效,如果对第三方有债务,那么债权人同样能够主张债权。
从你的陈述看,钱是你家出的,村里登记时是你父的名,(后又改成了你的名),也就是这个房的有限产权属于你家的,你爷没有权利处置不属于他的财产,所以他的协议不能第三方产生产作用,而这个第三方就是有效产权的实际拥有人。爷爷的协议上的此部分无效。