对系统本身进行编程？？
你是指linux的内核编程吧，
一般都是用C，
编辑器的话，
随便一个文本编辑器都可以，
楼上说的vim,
还有emacs都是很好的c编辑器。
一般的程序你只要写完代码用gcc编译和链接就好了，
复杂一点多文件的你需要写configure脚本（autoconf）和makefile。
或者你是意思是系统操作的编程，
那样的话shell(如
bash，csh),
perl
,
tcl/tk,等等脚本语言就能胜任得很好，
编辑器一样还是可以随便用的。
然后你说的指令集是指什么？
CPU,
内核？
还是库？
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