虽然到目前为止,冬瓜的原产地之争尚无定论,但是中国至少是冬瓜的次生起源地,而且中国从南到北,从东到西广泛分布着冬瓜种质资源。《中国蔬菜品种资源目录》(上册,1992;下册,1998)已收集登录冬瓜种质资源295份,到2005年11月止增至299份,另有节瓜种质资源69份。到目前为止还没有一个国家收集到野生种质资源。《中国蔬菜品种志》(2001)中较详细记录了82份冬瓜、22份节瓜的品种特性和栽培要点。
在295份冬瓜种质资源中果面多蜡粉品种196份,占总数的66.5%,中粉品种29份,占9.8%,少粉品种45份,占15.2%,无粉品种19份,占6.5%。覆盖蜡粉情况不详有6份,占2%。早熟资源54份,占总数的18.31%,中熟品种155份,占52.54%,晚熟品种86份,占29.15%。第一雌花节位在10以内的有27份,占总数的9.15%,11~19节的有158份,占53.56%,20节以上有106份,占35.93%,不详的有4份,占1.3%。
对于中国冬瓜种质资源的研究报道目前还很少,远不如大白菜、番茄、黄瓜等蔬菜深入。目前正在系统研究冬瓜的研究所主要有四川省成都市第一农业科学研究所和广东省农业科学院蔬菜研究所。湖南省长沙市蔬菜研究所和广西自治区农业科学院园艺研究所等几家单位也在进行品种选育。除了张建军等在2002年中国园艺学会论文集中发表的《冬瓜资源的收集与早熟性研究和利用》以外,国内尚少有冬瓜种质资源方面的研究报道。