厦门大学分校计划于2015年招收首批学生，至2020年将实现每年招收1万名学生目标，包括9000名本科生和1000名研究生。其中，马来西亚本地生源、中国国内生源以及其他国家（地区）生源各占三分之一。分校首阶段将设5个学院，分别是信息科学与技术、电子工程、医学院、经济与管理以及中国语言与文化，下设电子、生物工程、化学工程、医学、资讯通讯科技、商业与经济、中文及中国文学等科系，主要教学语言为英语和中文。“设立这些学院是我们在马来西亚经过多次调研，并充分征求多方人士的意见后确定的。应该说，这些都是马来西亚社会所需要的学科。”朱崇实介绍，第二期还将设化工与能源、生物工程、海洋与环境、材料、动漫与传媒5个学院。
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