您好：大部分肛瘘由直肠肛管周围脓肿引起，因此内口多在齿状线上肛窦处，脓肿自行破溃或切开引流处形成外口，位于肛周皮肤上。由于外口生长较快，脓肿常假性愈合，导致脓肿反复发作破溃或切开，形成多个瘘管和外口，使单纯性肛瘘成为复杂性肛瘘。瘘管由反应性的致密纤维组织包绕，近管腔处为炎性肉芽组织，后期腔内可上皮化；结核、溃疡性结肠炎、Crohn病等特异性炎症、恶性肿瘤、肛管外伤感染也可引起肛瘘，但较为少见。
直肠肛管周围脓肿：是形成肛瘘的最主要原因，95％以上的肛瘘皆由此引起，系由污染粪便滞留肛隐窝产生肛腺炎引起。
再就是直肠肛门损伤：由外伤、金属、肛门体温表、肛门镜检查等损伤肛管直肠，细菌侵入伤口引起
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