病原有性阶段为子囊菌门梨黑腐皮壳[Valsa ambiens（Pers.）Fr.]；无性阶段为迂回壳囊孢（Cytospora ambiens Sacc.）。病原的形态与苹果树腐烂病菌相似。分生孢子器埋生于子座内，1个子座有1个分生孢子器，孢子器有多个腔室，不规则形，具1个孔口。分生孢子器内壁密生分生孢子梗，分生孢子梗无色，单胞，不分枝。分生孢子香肠形，两端钝圆，无色，单胞，大小为4.5～4.9微米1.0～1.2微米。在辽宁南部地区曾发现此菌的有性阶段。梨树腐烂病菌寄生性不强，侵入必须通过伤口。
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