职能制组织结构，是各级行政单位除主管负责人外，还相应地设立一些职能机构。如在厂长下面设立职能机构和人员，协助厂长从事职能管理工作。这种结构要求行政主管把相应的管理职责和权力交给相关的职能机构，各职能机构就有权在自己业务范围内向下级行政单位发号施令。因此，下级行政负责人除了接受上级行政主管人指挥外，还必须接受上级各职能机构的领导。
直线－职能制，是在直线制和职能制的基础上，建立起来的。职能机构和人员，则是直线指挥人员的参谋，不能对直接部门发号施令，只能进行业务指导。
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