中国革命历史博物馆的独立时期

1983年，中国历史博物馆与中国革命博物馆恢复独立建制，中国革命历史博物馆这一名称正式暂告一段落。
1983年恢复独立建制以后，中国历史博物馆将旧民主主义革命陈列划归中国革命博物馆。1984年，“中国通史陈列”进行了第二次修改，在一定程度上加强了对历代社会经济文化的表现。1988年至1997年，开始进行“中国通史陈列”的第三次修改，在各文博单位的大力支持下，从全国各地征调了近千件文物，绝大多数是新出土的具有重要历史价值的文物，同时，陈列形式也作了全新的设计。修改后的“中国通史陈列”原始社会至魏晋南北朝时期于1990年第11届亚运会开幕之日对外开放，“中国通史陈列”隋唐至明清时期也于1997年9月正式展出。 1987年考古部设立水下考古学研究室，开始水下考古的研究。1989年与日本合作，对广东南海海域进行调查，并于1990年正式成立中日中国南海沉船调查学术委员会，先后对广东、山东、辽宁等地水域进行调查。1997年，中国历史博物馆成立遥感与航空摄影考古中心，同德国波鸿鲁尔大学签订了合作开展现代航空摄影考古意向书，开始进行洛阳及内蒙古东部地区古代大型遗址的航空摄影考古勘察。在新的历史时期，为了更好的发挥博物馆教育大众的作用，中国历史博物馆的群众工作也进入了一个新的发展高潮，先后举办了“湖南中学生‘拥抱红太阳’夏令营”、“我爱北京天安门”活动月，在北京市各中小学和部分边远郊县举办了“中国近代史图片展”、“中国古代科技成就展”等图片展览。
1999年，为庆祝中华人民共和国成立50周年，展示五十年来文物考古工作取得的多方面成就，由国家文物局主办、中国历史博物馆和中国革命博物馆承办的“中国文物事业50年特别展览”于国庆节前在博物馆中央大厅展出。同年该馆还成功举办了“盛世重光—山东青州龙兴寺出土佛教石刻造像精品展”，并参加了“雪域名珠—西藏文化展”和在法国举办的“中国文化周”的展览工作。为迎接21世纪的到来，同时也是欢庆新的龙年的到来，中国历史博物馆特别推出“迎千禧，贺辰岁—龙的艺术精品展”和“龙文化特展”，于2000年1月分别在北京和台北展出。相信在新世纪的曙光到来的时候，汇聚着古代文明与现代化气息的中国历史博物馆必将以全新的面貌展现于世人面前。
2003年2月28日，中国国家博物馆在合并中国历史博物馆与中国革命博物馆的基础上，正式挂牌成立。