不可以把用人单位股东个人作为被申请人。
劳动者与用人单位发生争议，不是与其中的股东个人发生争议，股东在公司工作并发放工资，其身份不是股东，也是劳动者，其行为是职务行为，由用人单位承担法律责任而非个人。劳动者申请劳动争议仲裁的，应当以用人单位为被申请人。
《劳动争议仲裁调解法》
第二十二条 发生劳动争议的劳动者和用人单位为劳动争议仲裁案件的双方当事人。
劳务派遣单位或者用工单位与劳动者发生劳动争议的，劳务派遣单位和用工单位为共同当事人。
《民法通则》
第四十三条 企业法人对它的法定代表人和其他工作人员的经营活动，承担民事责任
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