各种菌落表现出来的不同与菌体本身的结构有关，在菌落大小、形状、光泽度、颜色、硬度、透明度、等方面都表现出不同的特征，有鞭毛的细菌形成大而扁平，边缘呈波状或锯齿状的菌落，无鞭毛的球菌，常形成较小较厚，边缘较整齐的菌落。菌菌落光滑，易于基质脱离；放线菌菌落质地致密，菌落较小而不致广泛延伸；酵母菌菌落较细菌菌落大而厚；霉菌形成的菌落较稀松，多成绒毛状，絮状。
