用人单位应该这么办：
1、积极主动向当地的劳动监察大队提供员工不愿意自己参加社会保险法的书面证据，劳动者曾经与用人单位达成书面协议，同时用人单位已经每月按时将用人单位应该缴纳单位部分的社会保险法费支付给了员工，有工资支付单为证。
2、如果用人单位有证据证明没有《劳动合同法》第38条“(三)未依法为劳动者缴纳社会保险费的”过错存在，则劳动者没有依法离职而擅自走人属于旷工行为，用人单位调查落实后可以对该员工做出旷工处理。
3、《劳动合同法》第90条 劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
你好，你有证据将该部分费用已经补偿给职工了吗？
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