A、胚胎发育过程中，原肠胚期出现三个胚层的分化，并且由三胚层逐渐分化形成各种器官原基，A正确；B、囊胚期包括内细胞团和滋养层，其中滋养层将来发育成胎盘和胎膜，但是在囊胚期阶段并不发育，B错误；C、子宫不对外来胚胎发生免疫排斥反应，这为胚胎在受体内的存活提供了可能，C错误；D、囊胚外表面的一层扁平细胞称为滋养层，将来发育成胎盘和胎膜，D错误．故选：A．
