RNA 聚合酶II是一个多亚基的蛋白质复合物，CTD 结构是RNA 聚合酶II最大亚基的羧基末端的一段特殊的序列（仅RNA 聚合酶II具有，RNA 聚合酶I、III都不具有）。
CTD 尾具有高度保守的重复序列，由7个氨基酸（Tyr - Ser - Pro - Thr - Ser - Pro - Ser）组成重复单位。
mRNA在转录后需进行加工，有多种加工因子参与加工过程。CTD 尾可与 mRNA加工因子发生相互作用，而对mRNA的加工过程产生直接或间接的影响。所以CTD 尾在mRNA转录和加工的偶联过程中发挥了重要作用。
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