那要看税务部门不给退税的原因，如果是因为计算有误，做清算时有部分扣除项税务部门不允许扣除，那只能按照税务局的规定重新清算；如果确实没有问题，税务部门一般是不会做出不予退税的处理的，如果有可以到12366举报。
根据国税发〔2006〕187号文第八条规定处理
清算后再转让的房地产， 即在土地增值税清算时未转让的房地产，清算后销售或有偿转让的，纳税人应按规定进行土地增值税的纳税申报，扣除项目金额按清算时的单位建筑面积成本费用乘以销售或转让面积计算。
单位建筑面积成本费用=清算时的扣除项目总金额÷清算的总建筑面积?
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